Эстония находится на важной биогеографической границе между Восточной и Центральной Европой, которая разделяет всю местность на две зоны. Северная и западная части страны, с их характерными кальцефильными растительными группами альваров, болот, лесистых лугов и широколиственных лесов, принадлежат к центрально-европейской зоне, в то время как восточная часть, где почва способствует появлению кислотофильных растений и сосен, как основных лесообразующих деревьев, принадлежит к восточно-европейской зоне.